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植物异喹啉生物碱黄连素处理 SGC-7901 胃癌细胞的 microRNA-mRNA 表达谱和信号通路分析

 

Authors Yang YH, Zhang N, Li KD, Chen J, Qiu L, Zhang JF

Received 3 November 2017

Accepted for publication 22 January 2018

Published 28 February 2018 Volume 2018:12 Pages 393—408

DOI https://doi.org/10.2147/DDDT.S155993

Checked for plagiarism Yes

Review by Single-blind

Peer reviewers approved by Dr Palas Chanda

Peer reviewer comments 4

Editor who approved publication: Professor Manfred Ogris

目的:黄连素是用于治疗胃肠炎的传统中药,最近科研人员发现黄连素有抑制肿瘤的作用。本研究通过整合分析黄连素处理胃癌细胞系 SGC-7901 后 miRNA 测序和 RNA 测序的结果研究黄连素抑制胃癌细胞的机制。
方法:利用 WST-1 生长抑制实验和流式细胞术检测黄连素对胃癌细胞系 SGC-7901 增殖、凋亡及细胞周期的影响,进一步利用 miRNA 测序和 RNA 测序建立了黄连素处理 SGC-7901 细胞的 miRNAs  和 mRNA 差异表达谱。
结果:结果表明黄连素可以抑制 SGC-7901 细胞的增殖,使细胞周期产生 G1 期阻滞,并诱导凋亡。通过 RNA 测序,共得到 1,960 个表达水平上调的基因和 4,837 个表达水平下调的基因;通过 miRNA 测序,得到 347 个表达上调和 93 个表达下调的 miRNAs 并发现了一些新的 miRNAsGene Ontology (GO) 和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) 分析结果表明,差异表达的基因涉及到肿瘤及代谢等相关的信号通路。我们还进一步分析了细胞周期、凋亡、炎症、代谢、细胞连接、乙酰化相关基因、TGF-β  和 Wnt 信号通路相关基因的 miRNA-mRNA 调控网络。
结论:黄连素可以抑制 SGC-7901 细胞的增殖,并诱导凋亡。整合分析 microRNA-mRNA 表达谱是阐述胃癌相关基因表达模式并研究黄连素抗肿瘤机制的有效方法。
Keywords: berberine, gastric cancer, RNA sequencing, microRNA sequencing, integrated analysis