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来自中国杭州一家三级医院临床分离的碳青霉烯类耐药粘质沙雷菌的分子特征研究
Authors Xu Q, Fu Y, Zhao F, Jiang Y, Yu Y
Received 20 December 2019
Accepted for publication 13 March 2020
Published 7 April 2020 Volume 2020:13 Pages 999—1008
DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S243197
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewer comments 3
Editor who approved publication: Dr Joachim Wink
介绍:作为临床感染最常见的病原体,碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)已有许多相关的深入研究,但是其中关于粘质沙雷菌的报道仍显得表浅且不充分。
方法:本研究对本院 2018 年 4 月至 2019 年 3 月临床分离到的 36 株碳青霉烯类耐药粘质沙雷菌(CRSM)进行了全基因组测序(WGS)和分析。菌株的分子分型同时用了脉冲电场凝胶电泳(PFGE)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST)两种方法。
结果:36 株菌株中有 33 株因携带 bla KPC-2 质粒而对碳青霉烯类抗生素产生了耐药,余下 3 株细菌则发现存在 β-内酰胺酶过表达与膜孔蛋白缺失联合介导的耐药机制。所有菌株的 bla KPC-2 基因除一株菌株的 bla KPC-2 基因位于大小约 94 kb 的质粒上外,其余所有菌株的 bla KPC-2 基因均定位于一个大小约 103 kb 的质粒上。bla KPC-2 基因的周围结构由部分的 Tn4401 结构和完整的 IS26 整合而成。大多数 bla KPC-2 质粒还携带一种由 qnr 及 ISKpn19 构成的可移动基因元件(MGE),它为抗生素耐药性的水平转移提供了依据。
结论:CRSM 菌株在院内主要以携带 bla KPC-2 质粒及克隆播散的方式存在。包含 bla KPC-2 在内的基因周围结构以及包含 qnr 和 ISKpn19 在内的基因片段都可能通过水平转移的方式被粘质沙雷菌获得,从而加大临床感染程度和治疗难度。
关键词:粘质沙雷菌;碳青霉烯类耐药;携带 bla KPC-2 的质粒
