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活动性结核患者外周血单个核细胞 mRNA 和 miRNA 表达谱分析

 

Authors Cao D, Wang J, Ji Z, Shangguan Y, Guo W, Feng X, Xu K, Yang J

Received 25 August 2020

Accepted for publication 4 November 2020

Published 23 November 2020 Volume 2020:13 Pages 4223—4234

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S278705

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Editor who approved publication: Prof. Dr. Héctor Mora-Montes


目的:探研与活动性结核(Active TuberculosisATB)相关的核心基因(Hub gene)和 miRNA揭示该疾病进展的潜在分子机制。
方法:采用高通量测序和生物信息学分析方法,我们评估了 名活动性结核 (ATB) 患者和 名健康献血者(Healthy donorHD)外周血单个核细胞 mRNA 和 miRNA 的表达。此外,应用逆转录定量实时 PCRRT-qPCR检测 35 名 ATB 患者和 35 名 HD 来验证差异表达的 miRNA
结果:与健康供者相比,活动性结核患者中发现了 2658 个显著差异的表达基因其中包括 1415 个上调的差异基因和 1243 个下调的差异基因。PPI 网络分析发现了 10 个核心基因。与健康对照相比,活动性结核组中发现了 26 个显著差异表达的 miRNA。这些 miRNA 的某些靶基因也出现于测序发现的差异基因集中。RT-qPCR 结果证实了,与健康对照相比,活动性结核患者组中的 hsa-miR-23a-5pP=0.0106hsa-miR-183-5pP=0.0027hsa-miR-193a-5pP=0.0021和 hsa-miR-941P=0.0001的表达显著增高,而 hsa-miR-16-1-3p (P=0.0032) 的表达显著降低。
结论:我们的研究提供了 ATB 特征性的 mRNA 和 miRNA 表达谱,并发现与该疾病可能密切相关的核心基因,这有助于进一步探索 mRNA 和 miRNA 在 ATB 发病中的作用以及有助于结核病的鉴别诊断和治疗。
关键词:miRNAmRNA;活动性结核;高通量测序;RT-qPCR