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一种基于 ZG16 预测结直肠癌患者生存的新型预后评分
Authors Wang W, Sun JF, Wang XZ, Ying HQ, You XH, Sun F
Received 11 August 2020
Accepted for publication 1 December 2020
Published 16 December 2020 Volume 2020:13 Pages 735—747
DOI https://doi.org/10.2147/PGPM.S275941
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Editor who approved publication: Dr Martin Bluth
背景:结直肠癌是全世界范围内严重致死的恶性肿瘤之一。然而,其发病机理及相关靶标仍不甚明了。本研究旨在挖掘与结直肠癌密切相关的关键基因并探究其预后相关性。
方法:本研究纳入了来源于 GEO 数据库的四个结直肠癌表达谱数据集(GSE41657,GSE74602,GSE113513 和 GSE40967)以及 TCGA 数据库的结直肠癌转录组数据集。采用了 COX 模型进行单因素及多因素生存分析,选取 GEPIA 和 HAP 数据库对差异基因进行验证。进一步地,我们选择决策曲线分析及时间依赖 ROC 曲线对靶标的预测效能进行深入评价。
结果:通过比较结直肠癌及正常组织基因表达情况,我们共计筛选出 88 种差异表达基因,对之进行了 GO 和 KEGG 富集分析,随后构建蛋白互作网络,最终发现了包含 ZG16 在内的 15 种关键基因,ZG16 的差异表达在 GEPIA 和 HAP 数据库进一步验证。后续的生存分析发现 ZG16 的表达与结直肠癌患者的总生存期呈反相关,并且发现它是预测患者生存的独立预测因子。此外,在结直肠癌预后生存预测方面,基于ZG16 、年龄和 TNM 分期的评分系统展现了更加高效的预测能力。我们在 GSE40967 数据集里进一步验证了上述结果,证实评分系统对结直肠癌患者总生存期确实具有更好的预测效能。
结论:ZG16 是预测结直肠癌患者预后的潜在靶标,联合 TNM 分期和年龄能够有效提升预测效能。
关键词:结直肠癌;生物信息学;ZG16 ;预后评分;标志物