已发表论文

巴基斯坦临床分离的大肠杆菌中 mcr-1bla KPC-2 和 bla NDM-1 的分子流行病学研究

 

Authors Bilal H, Rehman TU, Khan MA, Hameed F, Jian ZG, Han J, Yang X

Received 20 January 2021

Accepted for publication 11 March 2021

Published 16 April 2021 Volume 2021:14 Pages 1467—1479

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S302687

Checked for plagiarism Yes

Review by Single anonymous peer review

Peer reviewer comments 4

Editor who approved publication: Professor Suresh Antony

摘要:耐多药大肠杆菌是最致命的病原体之一,会产生危及生命的感染。本研究拟对巴基斯坦临床分离的大肠杆菌的 mcr-1bla KPC-2 和 bla NDM-1 进行分子流行病学检测。
方法收集 2018 年 月至 2019 年 月临床标本中大肠杆菌 545 株。采用微量稀释法、双盘增效试验DDST和改良霍奇试验MHT对所有分离株进行粘菌素耐药、超广谱-β-内酰胺酶ESBL和碳青霉烯酶筛查。对 mcrESBL 和碳青霉烯酶编码基因进行检测、序列分型、偶联转移、S1-PFGE、质粒复制分型和 DNA 印迹。
结果0.73%耐粘菌素菌株同时携带 mcr-1  和 bla CTX-M-15 基因,其中 株还携带 bla TEM  基因。139 株分离株中检出 ESBL 基因,占 25.5%,同时分离出 blac TXM-1574.82%bla TEM34.53%bla SHV28.06%和 bla OXA-128.78%。在 129 个碳青霉烯酶菌株中,bla NDM-1 基因占 35.83%bla KPC-2 基因占 26.67%bla OXA-48 基因占 8.3%bla VIM-1 基因占 25%bla IMP-1 基因占 20.83%。序列分型结果显示,mcr-1  所携带菌株为 ST405ST117 和 ST156。在 ST131 和 ST1196 上 bla KPC-2 和 bla NDM-1 的阳性率分别为 50% 和 48.83%。本研究还鉴定出 ST7584 和 ST8671 两种罕见型菌株。mcr-1  基因定位于 Incl260 kb质粒上。bla KPC-2 位于140 kb IncH12100 kbIncN90 kbIncl1 上,bla NDM-1 位于70 kbIncFIIK140 kbIncH12100 kbIncN60 kbIncA/C 45 kbIncFII质粒上,并成功反式结合。在质粒类型中,Incl1 携带 bla KPC-2 IncH12 携带 bla KPC-2 和 bla NDM-1,而 IncFIIK 携带 bla NDM-1 在巴基斯坦首次被检测到。
结论在不同克隆类型和质粒类型中发现的 mcr-1bla KPC-2 和 bla NDM-1 基因表明在临床菌株中存在大量抗性基因的选择。
关键字 粘菌素耐药 超广谱-β-内酰胺酶; 碳青霉烯酶; mcr1 bla KPC-2 bla NDM-1;质粒;大肠杆菌