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基于 Taqman-MGB 探针的纳米颗粒辅助 PCR 技术用于单碱基突变的高特异性检测
Authors Xue Z, You M, Peng P, Tong H, He W, Li A, Mao P, Xu T, Xu F, Yao C
Received 9 March 2021
Accepted for publication 11 May 2021
Published 28 May 2021 Volume 2021:16 Pages 3695—3705
DOI https://doi.org/10.2147/IJN.S310254
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Editor who approved publication: Dr Lei Yang
背景:检测单碱基突变对实时监测肿瘤进展、治疗效果和耐药性具有重要意义。然而,常规的 PCR 技术难以从大量的野生型序列背景中特异性地检测单碱基突变。为了提高检测特异性,我们开发了基于 Taqman-MGB 探针的纳米粒子辅助 PCR 用于高特异性的单碱基突变检测。
方法和结果:以表皮生长因子受体碱基序列中第 2369 位的突变(EGFR T790M)作为研究模型,加入 AuNPs 来抑制野生型序列扩增,进而提高扩增的特异性。研究结果表明在该检测体系中,50 nM 的 AuNPs 可以显著提高扩增特异性,且其可以在 10-9μM 到 10μM 的模板浓度范围内提高特异性,能在加标样品中检测到低至 0.95% 的突变丰度。为了理解其中机理,我们提出了一个 “能量屏障” 假说,并在实验中得到了验证。
结论:基于 Taqman-MGB 探针的纳米粒子辅助 PCR 能显著提高 T790M 点突变的检测特异性,与现有的 qPCR 方法相比,该方法有望成为诊断各种已知突变基因相关疾病的有力工具。
关键词:单碱基突变,金纳米粒子,特异性, 能量屏障,突变丰度