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DSCC1 高表达预示肺腺癌预后不良
Authors Chang S , Zhu Y, Xi Y, Gao F, Lu J, Dong L, Ma C, Li H
Received 15 July 2021
Accepted for publication 20 August 2021
Published 20 October 2021 Volume 2021:14 Pages 6961—6974
DOI https://doi.org/10.2147/IJGM.S329482
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Editor who approved publication: Dr Scott Fraser
目的:评估 DSCC1 在 LUAD 中的作用。
患者及方法:基于 TCGA 和 GTEx,采用 Wilcoxon 秩和检验比较 GTEx 联合 TCGA 正常样本与 TCGA 未配对肿瘤样本之间 DSCC1 的表达差异,并比较 TCGA 队列中肿瘤组织和配对的正常 LUAD 组织之间的 DSCC1 表达值。采用 Kruskal-Wallis 秩和检验、Wilcoxon 秩和检验和 logistic 回归比较 DSCC1 的表达与临床病理参数的关系。GSEA 和 ssGSEA 解释了 DSCC1 的生物学功能,而 Kaplan-Meier 和 Cox 回归分析用于评估 DSCC1 的预后价值。此外,ROC 曲线用于分析 DSCC1 在 LUAD 中的诊断效能。
结果:我们下载了 513 个 LUAD 病例的 RNA-Seq 数据。 DSCC1 的表达与 T 分期(OR=1.04(1.02-1.07),P=0.002)、病理分期(OR=1.03(1.01-1.05),P=0.008)和 TP53 状态(OR=1.10(1.07)-1.14),P < 0.001)显著相关。DSCC1 的高表达与 DSS(HR=1.56(1.07-2.26),P=0.021)和 OS(HR=1.53(1.14-2.05),P=0.004)显著相关。此外,ROC 曲线分析(AUC=0.845,CI(0.848-0.909)表明 DSCC1 是 LUAD 的潜在诊断分子。在 DSCC1 高表达表型组中,EGFR 信号下调,IL-6 剥夺减少,细胞循环和 p53 信号通路显着富集。Spearman 相关分析表明 DSCC1 的表达与 Th2 细胞、T 辅助细胞的浸润呈正相关。
结论:我们的结果表明,DSCC1 可能是治疗 LUAD 的重要生物标志物。
Keywords: DSCC1, LUAD, GSEA, prognosis, biomarker