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中国东部地区结核分枝杆菌近期传播的基因组和空间分析:一项为期十年的基于人群的回顾性研究

 

Authors Yin X , Zhang Q, Wang Y , Tao B , Zhang X , Shi J, Deng X , Wang J 

Received 23 July 2024

Accepted for publication 21 September 2024

Published 30 September 2024 Volume 2024:17 Pages 4257—4269

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S480621

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Editor who approved publication: Prof. Dr. Héctor Mora-Montes

目的:了解结核分枝杆菌的传播方式对疾病的预防和控制至关重要。与传统的基因分型方法相比,全基因组测序提供了更高的分辨率和全面的遗传信息,使得能够追踪感染源并确定传播途径,从而解决大规模的结核病暴发。我们对中国东部地区的人群进行了为期十年的结核分枝杆菌传播研究。

方法:我们选择了中国东部城市连云港作为研究地点。研究对象为2011年至2020年期间被诊断为活动性肺结核的患者。我们分离并测序了2252株结核分枝杆菌。对于成对遗传距离小于12个单核苷酸多态性的菌株,定义为成簇,并认为是近期传播菌株。我们应用核密度估计和K函数分析来探讨近期传播菌株的空间分布。

结果:排除非结核分枝杆菌和重复样本后,最终纳入2114株菌株进行分析。这些菌株由L2谱系(1593株,占75.35%)和L4谱系(521株,占24.65%)构成。672株为成簇菌株,近期传播率为31.79%。逻辑回归模型显示,学生(aOR: 2.68, 95% CI: 1.63-4.49, P<0.001)和感染L2.2.1菌株的人群(aOR: 1.59, 95% CI: 1.20-2.12)近期传播的风险较高。在过去10年中,结核病传播主要集中在海州区、东海县和灌云县。三次暴发共46名患者,每次涉及1123人。不同群体之间,首例病例与后续病例的地理距离存在差异。

结论:研究地区存在结核分枝杆菌传播风险较高的区域,并且不同人群之间的传播风险有所差异。针对特定区域和重点人群制定精准的预防策略,有助于遏制结核病的流行。

关键词:结核病;传播;聚集簇;全基因组测序;空间分析