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KLF转录因子2 (KLF2)在人类肿瘤中预后作用的综合泛癌分析

 

Authors Xu R , Chen Y, Wei S, Chen J

Received 29 April 2024

Accepted for publication 24 October 2024

Published 2 November 2024 Volume 2024:17 Pages 887—904

DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S476179

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Editor who approved publication: Dr Nagashree Seetharamu

摘要

背景:KLF2是一种在哺乳动物发育早期表达的转录因子,在许多发育和疾病过程中发挥作用。近年来,越来越多的研究表明,KLF2在癌症的发生和发展中起着关键作用。目的:本研究的目的是利用癌症基因组图谱数据集探索KLF2在各种肿瘤类型中的作用。方法:利用TCGA (the Cancer Genome Atlas)、GEO (Gene Expression Omnibus)数据集、Human Protein Atlas (HPA)、UALCAN数据库、CancerSEA、GSCALite等多种生物信息学工具,探讨KLF2在33种肿瘤中的作用。此外,我们还通过免疫组织化学和qPCR进一步验证了KLF2在多种癌症中的作用及其与预后的相关性。结果:我们发现KLF2在大多数肿瘤中低表达,通常预测肿瘤患者的不良OS。我们发现KLF2扩增可能是OV(卵巢浆液性囊腺癌)患者的危险因素。我们还分析了与泛癌组织中KLF2表达水平显著相关的CD8+ T淋巴细胞、CD4+ T淋巴细胞、巨噬细胞和内皮细胞等特定免疫亚群的检查点和标记物的丰度。在某些癌症中,KLF2表达水平与基因启动子DNA甲基化和药物敏感性呈正相关。此外,我们发现KLF2参与一些癌症的单细胞水平细胞侵袭。KLF2也与几个参与免疫系统过程的细胞内信号转导基因共表达。免疫组织化学和qPCR证实了KLF2在STAD(胃腺癌)和肾癌中的低表达。结论:我们的泛癌症分析提供了KLF2在多种人类癌症中的致癌作用的全面概述,KLF2可以被视为癌症潜在的预后标志物和免疫治疗的新靶点。

关键词:KLF2,肿瘤,生物信息学,预后,免疫浸润