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筛选和研究血液miRNA作为甲状腺乳头状癌的潜在诊断标志物
Authors Li X , Qin W, Wang W, Liu W, Dong T, Liu A, Cai H, Xu Z, Zeng J
Received 12 September 2024
Accepted for publication 3 December 2024
Published 10 December 2024 Volume 2024:17 Pages 1173—1185
DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S489559
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Editor who approved publication: Dr Sanjay Singh
摘要:
目的:MiRNAs通过负向调控靶基因的表达,在肿瘤发生和发展中发挥关键作用。在本研究中,采用生物信息学技术和在线数据库来研究甲状腺乳头状癌中的特异性miRNA-mRNA调控网络,随后使用人类血液样本进行验证并与现有肿瘤标志物进行比较。方法:从GEO数据库中检索人甲状腺乳头状癌组织的miRNA(GSE50901)和mRNA(GSE113629)芯片筛选数据。使用GEO2R进行比较分析,以鉴定甲状腺乳头状癌患者的差异表达miRNAs和mRNAs。基于GO、KEGG、血液标本qRT-PCR检测、现有病理肿瘤标志物相关性分析、ROC分析,预测miRNA-mRNA调控网络、相关信号转导通路、生物学效应及其与预后的关系。结果:与相应的正常甲状腺组织相比,甲状腺乳头状癌患者中共有2116个miRNAs差异表达,包括1968个上调基因和148个下调基因。异常表达基因主要参与肿瘤发生和异常基因转录相关的信号通路。利用GEO数据库,鉴定出与甲状腺乳头状癌预后密切相关的5个miRNA,分别为miR-221-3p、miR-222-3p、miR-182-5p、miR-135a-5p和miR-34a-5p,并阐明了靶基因。通过实验验证、与肿瘤标志物的相关性分析以及生物信息学分析显示,甲状腺乳头状癌患者miR-182-5p表达水平显著增加,这与不良预后呈正相关。这些分子可以在甲状腺乳头状癌的发生和发展中发挥关键作用。结论:本研究通过生物信息学分析结合人类血液样本检测,发现了甲状腺乳头状癌潜在的新型血液miRNA生物标志物,为寻找与甲状腺乳头状癌诊断和预后相关的重要生物标志物提供新的可能性。
关键词:甲状腺乳头状癌;miRNA;差异表达基因;生物信息学;血液样本