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Friend白血病整合1转录因子作为类风湿关节炎新型免疫炎症生物标记物的多层次综合研究:连接生物信息学、临床队列和机制验证
Authors Zhang M, Wan L, Fang H, Zhang X, Wang S, Li F, Yan D
Received 30 November 2024
Accepted for publication 22 February 2025
Published 3 March 2025 Volume 2025:18 Pages 3105—3123
DOI https://doi.org/10.2147/JIR.S507941
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Editor who approved publication: Professor Ning Quan
摘要:目的:Friend白血病整合因子1(Friend Leukemia Integration 1 Transcription Factor, FLI1)因其在类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)中的潜在作用而备受关注。然而,FLI1参与RA的具体分子机制尚未完全阐明。本研究通过整合生物信息学分析、临床样本实验及体外细胞实验,系统探究了FLI1在RA中的潜在作用机制。方法:基于GSE1919和GSE12021数据集,京都基因和基因组百科全书(KEGG)和基因15本体论(GO)分析发现FLI1是RA的差异基因。通过检测RA患者血清中FLI1的表达水平进行临床验证。FLI1与免疫炎症标志物的相关性分析验证其与RA炎症的关联性。采用WGCNA分析、KnockTF、JASPAR和编码数据库预测FLI1的潜在靶基因。采用受试者工作特征分析(ROC)和基因集合富集分析-KEGG(GSEA-KEGG)阐明这些靶基因的生物学功能。通过细胞实验验证FLI1对其靶基因的调控作用及对RA患者滑膜细胞的影响。结果:FLI1在RA中上调,FLI1与CRP、ESR、CCP、RF、IL-6、IL-10、IL-8、TNF-α均呈正相关,FLI1与CRP、ESR、CCP、RF联合检测评估RA疾病活动度的效能最大。与FLI1高度相关的靶基因为AGA、DCK、LRRC15、MAN2A1、TES、AGA、DCK、LRRC15、MAN2A1和TES,与FLI1呈正相关。抑制FLI1表达可降低AGA、DCK、LRRC15、MAN2A1、TES表达并且降低RA滑膜细胞的活力,促进滑膜细胞凋亡。讨论:FLI 1及其靶基因可能是RA的治疗的潜在靶点。本研究整合了生物信息学和实验方法,为靶向治疗类风湿关节炎提供了新的方向。