摘要：乳头状肾细胞癌（PRCC）是肾细胞癌中第二常见的亚型，其缺乏有效的治疗靶点和预后分子生物学标志物。目前愈来愈多的研究集中于长链非编码 RNA（lncRNA），它可以作为竞争性内源 RNA（ceRNA）通过吸附微小 RNA分子（miRNA）反应元件从而调控编码蛋白基因的表达。因此，为了明确 lncRNAs 参与调节 PRCC 相关 ceRNA 网络的机制，本研究于 TCGA 公共数据库中获得分析 289 个 PRCC 组织和 32 个正常组织的表达谱，包括 mRNA, lncRNA, miRNA 的数据。本研究在 log2 fold change>2 及adjusted P -value <0.05 的阈值下，识别出 2,197 个差异性表达基因和 84 个差异性表达 miRNAs。为了确定可以作为关键靶基因的 hub DEmRNA，通过进行加权基因共表达网络分析（WGNCA），共有 28 个 hub DEmRNA 被鉴定为潜在的靶基因。而后确定了七个表达失调的 DEmiRNA 与 28 个关键靶基因具有关联性。此外，我们发现 16 个差异表达的 lncRNA 能够与 DEmiRNA 相互作用。最后，通过 Cytoscape 软件对这些差异性表达分子进行可视化网络的构建。CeRNA 网络在 PRCC 发展过程中起关键作用，而基于本研究中 PRCC 特异性 ceRNA 网络的成功构建将有助于对此疾病的机制认识，并且特异性网络中的分子与临床预后密切相关，可以为 PRCC 的诊疗提供新的潜在思路。
Keywords: papillary renal cell carcinoma, The Cancer Genome Atlas, weighted gene co-expression network analysis, long noncoding RNA, competing endogenous RNA network, survival prognosis