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已发表论文
肝细胞癌潜在预后相关基因的分析研究及竞争性内源 RNA 调控网络的构建
Authors Yue C, Ren Y, Ge H, Liang C, Xu Y, Li G, Wu J
Received 27 September 2018
Accepted for publication 11 December 2018
Published 14 January 2019 Volume 2019:12 Pages 561—576
DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S188913
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewers approved by Dr Cristina Weinberg
Peer reviewer comments 2
Editor who approved publication: Dr Takuya Aoki
背景：肝细胞癌是一种在世界范围内极为常见的恶性肿瘤。本研究旨在通过筛选肝细胞癌的潜在预后相关基因并构建一个竞争性内源性 RNA 调控网络，探讨肝细胞癌的发生、发展机制。
方法：用R软件分析 GSE14520、GSE17548、GSE19665、GSE29721、GSE60502 及 TCGA 数据库中的肝细胞癌相关数据，筛选出肝细胞癌的潜在预后相关基因。 通过 GO 及 KEGG 通路富集分析探讨潜在预后相关基因的分子作用机制。基于 TCGA 数据库筛选出肝细胞癌组织中异常表达的 miRNA 和 lncRNA，并通过来自 miRcode、TargetScan、miRTarBase 和 miRDB 数据库的基因相互作用数据，构建出一个 lncRNA - miRNA - mRNA 竞争性内源 RNA 调控网络。
结果：本研究共筛选出 152 个潜在预后相关基因，这些基因在肝细胞癌组织中异常表达，且与肝细胞癌患者的术后生存时间显著相关。在该竞争性内源 RNA 调控网络中，有 13 个关键的潜在预后相关基因：包括 11 个表达上调的基因（CCNB1 、CEP55 、CHEK1 、EZH2、KPNA2 、LRRC1 、PBK 、RRM2 、SLC7A11 、SUCO 和 ZWINT ）和 2 个表达下调的基因（ACSL1 和 CDC37L1 ），其表达可能受 8 个异常表达的 miRNA 和 61 个异常表达的 lncRNA 调控。Kaplan-Meier 分析显示，该竞争性内源调控网络中有 9 个异常表达的 lncRNA （AL163952.1、AL359878.1、AP002478.1、C2orf48、C10orf91、CLLU1、CLRN1-AS1、ERVMER61-1 和 WARS2-IT1）与肝细胞癌患者预后显著相关。
结论：本研究筛选出潜在的肝细胞癌预后相关基因并构建了一个 lncRNA-miRNA-mRNA 竞争性内源 RNA 调控网络，不仅对肝细胞癌的早期诊断具有重要的临床意义，并且提供了潜在的研究靶点，为肝细胞癌的治疗提供新的研究思路。
关键词：肝细胞癌，预后相关基因，竞争性内源 RNA
方法：用R软件分析 GSE14520、GSE17548、GSE19665、GSE29721、GSE60502 及 TCGA 数据库中的肝细胞癌相关数据，筛选出肝细胞癌的潜在预后相关基因。 通过 GO 及 KEGG 通路富集分析探讨潜在预后相关基因的分子作用机制。基于 TCGA 数据库筛选出肝细胞癌组织中异常表达的 miRNA 和 lncRNA，并通过来自 miRcode、TargetScan、miRTarBase 和 miRDB 数据库的基因相互作用数据，构建出一个 lncRNA - miRNA - mRNA 竞争性内源 RNA 调控网络。
结果：本研究共筛选出 152 个潜在预后相关基因，这些基因在肝细胞癌组织中异常表达，且与肝细胞癌患者的术后生存时间显著相关。在该竞争性内源 RNA 调控网络中，有 13 个关键的潜在预后相关基因：包括 11 个表达上调的基因（CCNB1 、CEP55 、CHEK1 、EZH2、KPNA2 、LRRC1 、PBK 、RRM2 、SLC7A11 、SUCO 和 ZWINT ）和 2 个表达下调的基因（ACSL1 和 CDC37L1 ），其表达可能受 8 个异常表达的 miRNA 和 61 个异常表达的 lncRNA 调控。Kaplan-Meier 分析显示，该竞争性内源调控网络中有 9 个异常表达的 lncRNA （AL163952.1、AL359878.1、AP002478.1、C2orf48、C10orf91、CLLU1、CLRN1-AS1、ERVMER61-1 和 WARS2-IT1）与肝细胞癌患者预后显著相关。
结论：本研究筛选出潜在的肝细胞癌预后相关基因并构建了一个 lncRNA-miRNA-mRNA 竞争性内源 RNA 调控网络，不仅对肝细胞癌的早期诊断具有重要的临床意义，并且提供了潜在的研究靶点，为肝细胞癌的治疗提供新的研究思路。
关键词：肝细胞癌，预后相关基因，竞争性内源 RNA
