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Authors Yang Y, Zhao Y, Zhang W, Bai Y
Received 19 November 2018
Accepted for publication 11 February 2019
Published 10 April 2019 Volume 2019:12 Pages 2737—2747
DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S195235
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewers approved by Dr Colin Mak
Peer reviewer comments 2
Editor who approved publication: Dr Sanjeev Srivastava
目的:本研究旨在研究结肠癌相关的关键长链非编码 RNA(lncRNA)并阐明其可能的作用机制。
患者和方法:收集 8 例早期结肠肿瘤组织,8 例晚期收集结肠肿瘤组织和 8 例癌旁正常组织,并进行高通量 RNA 测序。对 RNA 测序结果进行综合的生物信息学分析,包括差异表达的 mRNAs 和 lncRNAs 筛选,功能富集分析,蛋白质 - 蛋白质相互作用网络和 miRNA-lncRNA-mRNA 调控网络构建。此外,关键 lncRNA 的表达使用实时定量 PCR(qPCR)验证了。
结果:与正常样本比较,在早期结肠癌和晚期结肠癌中,共有 549 种相同的差异表达 mRNA,和 30 种相同的差异表达 lncRNA。功能富集分析显示 KIAA0125 在 PI3K-Akt 信号通路中显著富集,MSTRG.35002.1 显著富集到 BMP 信号相关功能。此外,关键的 miRNA-lncRNA-mRNA 关系被鉴定出来,如 hsa-miR-29b-3p-KIAA0125-BCL2 和 hsa-miR-29b-3p-MSTRG.35002.1-MMP2。qPCR 测定证实了与正常结肠组织比较,KIAA0125 和 ESTRG.35002.1 在早期和晚期结肠癌组织中均显著下调。
结论:我们的研究结果表明关键的 lncRNAs,包括 KIAA0125 和 MSTRG.35002.1,可能参与结直肠癌的发展。KIAA0125 的下调可能通过海绵吸附 hsa-miR-29b-3p 进而调控 BCL2 的表达或通过调控 PI3K-Akt 信号通路,参与 CRC 的发展。MSTRG.35002.1 的下调可能通过海绵吸附 hsa-miR-29b-3p 进而调控 MMP2 的表达或通过调控 BMP 信号通路来促进 CRC 的发展。
Keywords: colon cancer, differentially expressed mRNAs,
differentially expressed lncRNAs, molecular mechanism, CeRNA network
