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利用外显子测序技术检测同一个患者体内不同组织病理类型的多发性脑膜瘤揭示其不同的体细胞突变负荷以及独立的克隆性起源

 

Authors Sheng HS, Shen F, Zhang N, Yu LS, Lu XQ, Zhang Z, Fang HY, Zhou LL, Lin J

Received 21 January 2019

Accepted for publication 21 March 2019

Published 6 May 2019 Volume 2019:11 Pages 4085—4095

DOI https://doi.org/10.2147/CMAR.S202394

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Editor who approved publication: Dr Kenan Onel

背景:虽然脑膜瘤是常见的颅内肿瘤,但多发性脑膜瘤(MMs)在没有 型神经性纤维瘤病的患者中实属罕见。既往研究表明,大多数散发性MM都是单克隆起源的。
目的:利用新一代测序(NGS)平台,阐明来自同一患者的两个散发性脑膜瘤的克隆关系。
方法:从一名 52 岁的男性手术中取出两个分别位于右额部和顶部的多发性脑膜瘤。对肿瘤样品进行病理学检查和全外显子组测序,然后进行 Sanger 测序验证。
结果:多发性脑膜瘤分别被诊断为分泌性和纤维型组织亚型(WHO I 级),肿瘤 DNA 表现出独特的体细胞突变模式。具体地,分泌亚型携带更多的单核苷酸变体,而纤维亚型具有更高的拷贝数变异。此外,这两种肿瘤在易感基因和已知的驱动突变中表现出不同的突变谱。例如,分泌亚型在 TRAF7  和 KLF4  中具有错义突变,而纤维亚型除了 NF2  和 SMARCB1  的拷贝数丢失外,还具有 NF2  基因的移码缺失,这些遗传事件已经与脑膜瘤的发展相关联。显著性突变的基因分析揭示了分泌亚型中的 LOC729159  和纤维亚型中的 RPGRIP1L  和 DPP6  的新突变。 Sanger 测序验证了 TRAF7 c.1678G> A.G560S),KLF4 c.1225A> C.K409Q)和 CDH11 c.169T> G.W57G)等重要的点突变事件。
结论:我们的数据表明,这两例脑膜瘤可能在该患者中独立发展而来,而 NGS 的分子亚型分析是对常规病理学的有价值的补充。接下来需要进一步研究以确定这些新的遗传事件是致瘤性还是简单的乘客突变,以及它们的临床意义。
Keywords: multiple meningiomas, whole exome sequencing, secretory meningioma, fibrous meningioma, TRAF7 NF2




Figure 3 Distinctive somatic mutation patterns for single nucleotide variants (SNVs) and...