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PRPF40A 在胰腺癌组织和细胞系中上调并能够作为胰腺癌诊断及预后标志物
Authors Huo Z, Zhai S, Weng Y, Qian H, Tang X, Shi Y, Deng X, Wang Y, Shen B
Received 19 February 2019
Accepted for publication 31 May 2019
Published 28 June 2019 Volume 2019:12 Pages 5037—5051
DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S206039
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewers approved by Ms Shreya Arora
Peer reviewer comments 2
Editor who approved publication: Dr Sanjeev Srivastava
背景:PRPF40A 是参与 mRNA 前体剪接修饰的一个重要的蛋白质并且在多种细胞组织中均有表达,但是其在胰腺癌中的功能仍然不清楚。因此,此次研究是为了探明 PRPF40A 在胰腺癌发生发展中的作用。
材料与方法:我们从 TCGA,Oncomine 和 GEO 等在线公共数据库中下载了 PRPF40A 的表达谱及临床相关性数据。我们也收集了 44 对病人样本并对其进行了实时定量 PCR,蛋白印迹和免疫组化分析。ROC 曲线和 K-M 曲线用来评估诊断及预后价值。克隆形成实验和 CCK8 实验用以检测细胞的增殖能力。最后,借助 DAVID 在线分析工具针对 PRPF40A 的共表达基因进行了功能和通路富集分析。
结果:通过分析在线数据库和我们的样本,发现 PRPF40A 在胰腺癌组织中显著上调。 PRPF40A
具有一定的诊断价值,其高表达与不良预后相关。PRPF40A 敲减后显著抑制了胰腺癌细胞的增殖。功能及通路富集分析显示 PRPF40A 的共表达基因富集在病毒蛋白加工,mRNA 剪切和 AMPK 信号通路上。
结论:PRPF40A 是胰腺癌的致癌基因并能作为胰腺癌的诊断和预后标志物,然而其作用机制仍有待研究。
Keywords: PRPF40A,
pancreatic cancer, diagnosis, prognosis, biomarker
