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鉴定潜在预后生物标志长链非编码 RNA 以预测宫颈癌患者的复发
Authors Zhang Y, Zhang X, Zhu H, Liu Y, Cao J, Li D, Ding B, Yan W, Jin H, Wang S
Received 20 September 2019
Accepted for publication 19 December 2019
Published 31 January 2020 Volume 2020:12 Pages 719—730
DOI https://doi.org/10.2147/CMAR.S231796
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewer comments 4
Editor who approved publication: Dr Seema Singh
背景:宫颈癌(cervical cancer,CC)是女性最常见的恶性肿瘤之一,其治疗通常伴有高复发率。我们旨在鉴定与 CC 复发相关的长链非编码 RNA(lncRNA)。
方法:我们从癌症基因组图谱(TCGA)数据集下载了 CC 患者的 lncRNA 表达数据,并使用 Cox 回归模型分析了 lncRNA 与 CC 复发的关系。用显著相关的 lncRNAs 构建复发风险评分(RRS)模型。通过生物信息学分析评估关键 lncRNA 在 CC 复发中的潜在作用。最后通过体外实验确定了关键 lncRNA 对 CC 表型的影响。
结果:通过 Cox 回归分析得到四种 lncRNA,即 HCG11,CASC15,LINC00189 和 LINC00905,与 CC 的较差的无复发生存率(RFS)显著相关,而其它三种 lncRNA(HULC,LINC00173 和 MIR22HG),则与之相反。建立 RRS 模型后,通过 Kaplan-Meier 分析,结果显示高 RRS 患者的复发风险显著增加。在 TCGA 数据库中含有对照组织的 20 种肿瘤中,MIR22HG 和 HCG11 分别在包括 CC 在内的 18 种和 10 种肿瘤均显著下调。 MIR22HG 的上调与年龄 <45(危险比(HR)= 0.26),I/II 期(HR = 0.33),T 期 I/II(HR = 0.30),化学疗法(HR = 0.18)和分子疗法(HR = 0.16))的亚组中复发风险的降低显著相关。在功能上,MIR22HG 表达上调可以抑制 CC 细胞增殖,迁移和侵袭。
结论:MIR22HG 在 CC 复发中具有重要作用,并可作为潜在的预后生物标志。
关键字:TCGA;lncRNA;宫颈癌;复发生物标志
