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鉴定和验证铁死亡相关特征基因标记与乳头状肾细胞癌预后和免疫微环境相关性研究

 

Authors Da Q, Ren M, Huang L, Qu J, Yang Q, Xu J , Ma Q, Mao X, Cai Y, Zhao D, Luo J, Yan Z, Sun L, Ouyang K, Zhang X, Han Z, Liu J, Wang T

Received 7 January 2022

Accepted for publication 8 March 2022

Published 15 March 2022 Volume 2022:15 Pages 2963—2977

DOI https://doi.org/10.2147/IJGM.S354882

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Editor who approved publication: Dr Scott Fraser

目的:探讨铁死亡相关基因在乳头状肾细胞癌(PRCC)中的预后模式,探讨铁死亡相关基因与 PRCC 肿瘤免疫微环境的关系。
方法:我们从公共肿瘤癌症基因组图谱数据库(TCGA)中获得 PRCC 的 mRNA 表达和相应的临床数据。将 PRCC 患者随机分为两个队列,分别为训练队列和验证队列。利用单变量 Cox 回归、LASSO Cox 回归、多变量 Cox 回归分析用于构建 PRCC 患者的铁死亡特征基因标记,进而建立并验证了风险预测模型。系统分析了铁死亡相关特征基因标记与生存和免疫微环境的相关性。
结果:构建了 4 个基因的铁死亡特征标记(CDKN1AMIOXPSAT1 RRM2)。多变量 Cox 回归分析表明,铁死亡特征的风险评分是一个独立的预后指标(HR=1.391p<0.001)。生存曲线显示高风险组的预后显著比低风险组差(p<0.001)。基于临床分期、血红蛋白和风险评分等预后因素建立风险预后模型。时间相关的受试者工作特征曲线(ROC)分析证明了铁死亡特征基因标记的预测能力,年曲线下面积(AUC)为 0.890年 AUC 为 0.733。进一步分析表明,细胞周期、磷酸戊糖通路和 P53 信号通路在高风险组显着富集。在风险组中观察到树突状细胞、巨噬细胞和 T 细胞滤泡辅助细胞的浸润存在显著差异。
结论:本研究表明铁死亡特征基因标记对 PRCC 患者的预后具有良好的预测能力。铁死亡相关基因可能在抗肿瘤过程中起关键作用,并作为 PRCC 的治疗靶点。
关键词:乳头状肾细胞癌,铁死亡,基因特征标记,预后模型,肿瘤免疫微环境