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宏基因组二代测序在 HIV 感染者疑似机会感染诊断中的临床应用

 

Authors Xu J, Huang Q, Yu J, Liu S, Yang Z, Wang F, Shi Y, Li E, Li Z, Xiao Y

Received 10 January 2022

Accepted for publication 25 March 2022

Published 11 April 2022 Volume 2022:15 Pages 1767—1775

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S350047

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Editor who approved publication: Professor Héctor M Mora-Montes

目的:由于潜在病因的广泛性,HIV 患者疑似机会感染的诊断具有挑战性。本研究使用宏基因组二代测序(mNGS)在单个中心对艾滋病感染者中疑似机会感染患者标本进行分析,以探索其作为诊断工具的适用性。
方法:回顾性调查 2020 年 月至 2021 年 月在杭州市西溪医院住院的 46 名疑似机会感染的艾滋病病毒感染者(PLWH),收集他们的 49 例样本(其中 名患者送了 个部位样本)送检 mNGS,并与综合常规微生物试验进行比较。
结果:在对真菌和非结核分枝杆菌的检出率上,mNGS 体现较大优势。真菌(11 Vs 19P<0.05)非结核分枝杆菌(1 Vs 6p<0.05),而在其他病原体(细菌、结核分枝杆菌、病毒)的诊断检出率上,两者并无统计学差异。mNGS 在诊断真菌、细菌、结核分枝杆菌、非结核分枝杆菌、病毒方面的敏感性分别是 90.91%50%0%100%100%;特异性分别是 74.29%97.73%86.36%86.67%91.11%
结论:宏基因组二代测序技术为疑似机会感染的艾滋病患者提供了一种可供选择的有前景的检测手段。mNGS 和 CMTs 的诊断联合应用可能是最佳的诊断策略。
关键词:宏基因组二代测序,感染,病因诊断,艾滋病,机会感染