目的：结核分枝杆菌引起的结核病仍然是全球十分关注的问题。本研究首次通过全基因组测序分析中国天津地区氟喹诺酮类耐药和耐多药结核分枝杆菌的分子特征。
方法：21 株氟喹诺酮类耐药和耐多药结核分枝杆菌的分离株来自痰液标本。应用药物敏感性试验确定 12 种抗结核药物的表型耐药性。根据与耐药相关的基因区域，应用全基因组测序预测结核分枝杆菌的基因型耐药性。根据表型药物敏感试验结果评价全基因组测序预测耐药性的敏感性。
结果：在 21 株分离株中，检测到与耐药相关的 15 个基因突变区域，包括：利福平耐药相关的 rpoB 基因；异烟肼耐药相关的 katG 和 inhA 启动子；氧氟沙星和莫西沙星耐药相关的 gyrA 和 gyrB 基因；链霉素耐药相关的 rpsL 基因；链霉素、阿米卡星、卡那霉素和卷曲霉素耐药相关的 rrs 基因；吡嗪酰胺耐药相关的 pncA 和 panD 基因；乙胺丁醇耐药相关的 embB、embC-embA、aftA 和 ubiA 基因；丙硫异烟胺耐药相关的 ethA 基因；对氨基水杨酸耐药相关的 folC 基因。与传统药物敏感试验结果相比，全基因组测序预测结核分枝杆菌对利福平、异烟肼、氧氟沙星、莫西沙星、链霉素、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、卡那霉素和阿米卡星耐药性的敏感性分别为 100%、90.48%、95.24%、92.86%、95.27% 、85.71%、66.67%、50% 和 50%。本文没有评价全基因组测序预测结核分枝杆菌对卷曲霉素、丙硫异烟胺和对氨基水杨酸耐药性的敏感性，因为该 3 种药物分别仅有一株分离株有表型耐药结果。在大多数结核分枝杆菌分离株中耐药相关基因突变能解释其表型耐药。需要注意的是，在一些耐药菌株中并不存在这些突变，提示结核分枝杆菌还存在其他耐药机制。
结论：全基因组测序能有效地诊断氟喹诺酮类耐药和耐多药结核病，尽管它还存在一些缺陷。在中国天津地区，在进行传统表型药物敏感试验之前，应该先使用全基因组测序预测结核分枝杆菌耐药性。
关键词：结核分枝杆菌，结核病，氟喹诺酮类, 突变, 耐药性, 全基因组测序