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泛癌分析及数字化病理检测揭示预后标志物 ZPR1 与肝细胞癌免疫浸润和治疗反应密切相关
Authors He L , Xie Y , Qiu Y , Zhang Y
Received 1 May 2023
Accepted for publication 20 July 2023
Published 9 August 2023 Volume 2023:10 Pages 1309—1325
DOI https://doi.org/10.2147/JHC.S415224
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Editor who approved publication: Professor Jörg Trojan
目的:ZPR1 是一种含锌指结构的新型蛋白,在神经退行性疾病、脂质代谢紊乱和非酒精性脂肪性肝病中发挥着重要的作用。然而,ZPR1 在泛癌和肝细胞癌(HCC)中的表达模式、预后意义和治疗反应尚不明确。
方法:从 UCSC Xena 平台获取泛癌表达谱及相关临床数据。对 ZPR1 进行泛癌分析、表观遗传学分析和临床相关性分析。我们接下来探究 ZPR1 在 HCC 中的预后意义和潜在的生物学功能。此外,我们研究 ZPR1 与免疫浸润和治疗反应之间的关系。最后,应用 Qupath 软件对免疫组织化学芯片结果进行定量病理分析,评估 ZPR1 表达与 HCC 组织中免疫微环境的相关性。
结果:ZPR1 在大多数肿瘤类型中差异表达,并在 HCC 中表达显著上调。ZPR1 在大多数肿瘤中呈低甲基化状态。泛癌相关性分析显示,ZPR1 与 HCC 的临床病理因素、TMB、MSI 及干性指数密切相关。ZPR1 高表达是 HCC 患者不良预后的独立危险因素。ZPR1 与免疫细胞浸润和治疗反应密切相关。最后,Qupath 定量分析结果表明 ZPR1 与 CD4、CD56、CD68 和 PD-L1 表达显著相关,有望成为 HCC 病理诊断标志物。
结论:免疫浸润相关的 ZPR1 可以作为一个预测 HCC 治疗反应的新型预后标志物。
关键词:肝细胞癌;ZPR1;预后;数字化病理;泛癌分析