已发表论文

鉴定和验证潜在的预后基因生物标记物用于预测急性髓细胞白血病患者的生存

 

Authors Huang R, Liao XW, Li Q

Received 29 July 2017

Accepted for publication 4 October 2017

Published 2 November 2017 Volume 2017:10 Pages 5243—5254

DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S147717

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Editor who approved publication: Dr Ingrid Espinoza

背景:分子分析是临床上有用的预后生物标志物最有希望的来源。本研究的目的是通过使用公共数据库中的基因表达谱数据集来鉴别急性髓细胞白血病(AML)患者的预后生物标志物。
方法:本研究分别纳入了 GSE12417 和癌症基因组图谱(TCGALAML 项目的三组 AML 患者的基因表达谱数据集和相应的总体生存信息。预后基因筛查通过使用 survival 包进行,而时间依赖性 ROC 曲线分析使用 survivalROC 包执行。
结果:在三个队列中,确定了 11 个与 AML 总体生存显着相关的基因。通过 GSE12417 HG-U133 A 队列的多因素 Cox 回归分析,使用回归系数(β )加权构建了 11 个基因的线性预后模型,从而将患者分成高风险组和低风险组。GSE12417 HG-U133 plus 2.0 和 TCGA LAML 队列是验证队列。与低风险组患者相比,分配到高风险组的患者表现出较差的预后。11 基因识别标记是 AML 的预后标志物,并且通过 survivalROC 评估提示该模型在三个队列中预测 AML 的 年,年和 年总生存上表现出良好的性能。
结论:我们的研究确定了一个包括 11 个基因的 mRNA 识别标志,这个识别标志有可能成为 AML 潜在预后标志物。
关键词:急性髓细胞白血病,预后,生物标志物,GEOTCGA