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基于核糖体蛋白检测的质谱分析技术 VITEK (V 3.0) 在临床烟曲霉菌感染快速鉴定中的应用

 

Authors Zhou L, Chen Y, Xu Y

Received 3 August 2017

Accepted for publication 31 October 2017

Published 8 December 2017 Volume 2017:10 Pages 499—506

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S148121

Checked for plagiarism Yes

Review by Single-blind

Peer reviewers approved by Dr Akshita Wason

Peer reviewer comments 2

Editor who approved publication: Dr Sahil Khanna

摘要:临床患者感染烟曲霉菌现象日趋严重,由于烟曲霉菌的错误鉴定严重影响患者的临床治疗,因此,快速准确鉴定烟曲霉菌具有重要的临床意义。本研究将传统形态学方法初步鉴定为烟曲霉菌的 52 株菌株接种于三种不同的培养基中,并在不同温度下进行培养,提取不同培养时间点待检菌的核糖体蛋白,使用质谱分析技术 VITEKV3.0)进行鉴定,获取待检菌的特异性指纹图谱,从而评估 VITEKV3.0)在烟曲霉菌快速鉴定中的应用价值。在所有菌株中,88.5%46/52)的菌株被 VITEKV3.0)鉴定为烟曲霉,而 11.5%6/52)的菌株鉴定结果与形态学鉴定结果不一致。我们使用分子测序作为待检菌鉴定的参考方法,对 VITEKV3.0)与形态学鉴定结果进一步验证。卡方检验(2 检验,= 0.05)分析表明,培养基种类和培养温度对鉴定准确率无影响,但培养 48 h 组的菌株鉴定准确率低于其他培养时间组。此外,我们发现从烟曲霉菌中提取的核糖体蛋白可以在不同的环境中保存至少1周,在此期间蛋白的检测质谱图保持稳定,对烟曲霉菌的鉴定结果不会产生影响,这对于尚未购买质谱仪的医疗机构非常有益。本研究充分显示了质谱分析技术 VITEKV 3.0)在烟曲霉菌的鉴定方面明显优于传统形态学方法。
Keywords: VITEK MS V 3.0, Aspergillus fumigatus , identification, ribosomal protein, spectral fingerprints, fungal, matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS