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已发表论文
利奈唑胺耐药粪肠球菌的流行病学特征及基因结构特点
Authors Chen M, Pan H, Lou Y, Wu Z, Zhang J, Huang Y, Yu W, Qiu Y
Received 25 July 2018
Accepted for publication 6 October 2018
Published 20 November 2018 Volume 2018:11 Pages 2397—2409
DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S181339
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewers approved by Dr Andrew Yee
Peer reviewer comments 3
Editor who approved publication: Dr Joachim Wink
目的：探讨利奈唑胺耐药粪肠球菌（linezolid-resistant Enterococcus faecalis ，LZR-Efa）的耐药机制，并评估 LZR-Efa 感染的危险因素。
方法：收集 730 株粪肠球菌，筛选出 LZR-Efa 进行全基因组测序并进行生物信息学分析。同时对 LZR-Efa 感染的危险因素采用二元 Logistic 回归分析。
结果：分离出 26 株 LZR-Efa，其中 24 株为多重耐药菌。26 株菌对万古霉素敏感，4 株菌对达托霉素不敏感。在 13 种 ST 型中，ST16 最为常见（23.1%）。在 26 株 LZR-Efa 中均检测到 dfrE ，lsaA 和 emeA 耐药基因。23 株菌检测到 OptrA 基因，并且在 18 株中检测到 OptrA 存在 6 个氨基酸突变。在 16 株菌中检测到 23S rRNA 基因突变。所有菌株未检测到 cfr 基因。通过毒力基因比对，检测到 41 个毒力基因，其中 10 个毒力基因（ace ，bopD ，cpsA ，cpsB ，ebpB ，ebpC ，efaA ，fss1 ，fss2 ，srtC ）在所有 LZR-Efa 中均存在。在 9 株菌中检测到同时携带多个毒力基因（ace ，asa1 ，cylA ，efaA ，esp ，gelE ）。不同标本的毒力因子不存在差异（P =0.825）。值得注意的是，所有患者均未接受过利奈唑胺治疗或出国旅行。通过危险因素分析发现，碳青霉烯类抗菌药物是感染 LZR-Efa 的危险因素。
结论：LZR-Efa 呈散发流行趋势，多见于外科病房，对利奈唑胺呈低水平耐药。OptrA 基因和 23S rRNA 突变是导致耐药的主要机制。此外，碳青霉烯类抗菌药物是导致 LZR-Efa 感染的独立危险因素。
关键词：利奈唑胺，耐药机制，毒力因子，危险因素
方法：收集 730 株粪肠球菌，筛选出 LZR-Efa 进行全基因组测序并进行生物信息学分析。同时对 LZR-Efa 感染的危险因素采用二元 Logistic 回归分析。
结果：分离出 26 株 LZR-Efa，其中 24 株为多重耐药菌。26 株菌对万古霉素敏感，4 株菌对达托霉素不敏感。在 13 种 ST 型中，ST16 最为常见（23.1%）。在 26 株 LZR-Efa 中均检测到 dfrE ，lsaA 和 emeA 耐药基因。23 株菌检测到 OptrA 基因，并且在 18 株中检测到 OptrA 存在 6 个氨基酸突变。在 16 株菌中检测到 23S rRNA 基因突变。所有菌株未检测到 cfr 基因。通过毒力基因比对，检测到 41 个毒力基因，其中 10 个毒力基因（ace ，bopD ，cpsA ，cpsB ，ebpB ，ebpC ，efaA ，fss1 ，fss2 ，srtC ）在所有 LZR-Efa 中均存在。在 9 株菌中检测到同时携带多个毒力基因（ace ，asa1 ，cylA ，efaA ，esp ，gelE ）。不同标本的毒力因子不存在差异（P =0.825）。值得注意的是，所有患者均未接受过利奈唑胺治疗或出国旅行。通过危险因素分析发现，碳青霉烯类抗菌药物是感染 LZR-Efa 的危险因素。
结论：LZR-Efa 呈散发流行趋势，多见于外科病房，对利奈唑胺呈低水平耐药。OptrA 基因和 23S rRNA 突变是导致耐药的主要机制。此外，碳青霉烯类抗菌药物是导致 LZR-Efa 感染的独立危险因素。
关键词：利奈唑胺，耐药机制，毒力因子，危险因素
