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ICAM1 调节胃癌的发展并可能是胃癌早期诊断和预后的潜在生物标志物

 

Authors Chen S, Pan S, Wu H, Zhou J, Huang Y, Wang S, Liu A

Received 5 November 2019

Accepted for publication 31 January 2020

Published 2 March 2020 Volume 2020:12 Pages 1523—1534

DOI https://doi.org/10.2147/CMAR.S237443

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Editor who approved publication: Dr Ahmet Emre Eskazan

背景:胃癌(GC)是影响消化系统的最常见癌症之一。这项研究试图确定调节早期胃癌(EGC)的枢纽基因,以探索其在患者早期诊断和预后方面的潜力。
方法:我们利用了来自 Gene Expression Omnibus 数据库(GSE55696)的公开可用数据集。使用 limma 包比较了 EGC 和 LGIN 之间在基因表达方面的差异。鉴定出的差异表达基因(DEG)经过 DAVID 数据库进行基因本体(GO)和通路富集分析,STRING 网站和 Cytoscape 软件用于构建包含这些 DEG 的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。该网络又被用来在选定的 DEGs 中识别中心基因,并用 Kaplan-Meier plotter 数据库对其进行了分析。此外,蛋白质印迹,qRT-PCR,免疫组织化学和 UALCAN 均被用于验证这些基因的表达与 GC 患者预后之间的关系。
结果:共鉴定出 482 个 DEGsGO 分析表明与癌症发展相关的基因表达增加。通路分析还表明,这些基因在某些癌症相关通路中起作用。 PPI 网络强调了四个潜在的中枢基因,其中只有 ICAM1 与 GC 患者的不良预后相关。通过 UALCAN,蛋白质印迹,免疫组织化学和 qRT-PCR 证实了 ICAM1 和 GC 患者预后之间的这种联系。
结论:ICAM1 可能调节 GC 的肿瘤进展,并可能是有价值的 EGC 预后和早期诊断的生物标志物。
关键词:生物信息学分析,胃癌,早期诊断,ICAM1,生物标志物