背景：慢性阻塞性肺疾病（COPD）已经成为全球发病率和死亡率较高的疾病之一。越来越多的研究表明，异常表达的微小 RNA（miRNA）参与了 COPD 的发生发展过程。然而，尚缺乏对 COPD 血浆中 miRNA-mRNA 综合调控网络的构建。
方法：从公共基因芯片数据库（GEO）下载微阵列数据集 GSE24709，GSE61741 和 GSE31568，并使用 GEO2R 在线分析工具筛选出 COPD 患者和正常人血浆之间的差异表达 miRNA（DEM），选择在上述三个数据集中具有一致变化的 miRNA 作为候选 DEM。候选 DEM 的潜在上游转录因子和下游靶基因分别由 FunRich 软件和 miRNet 数据库预测。然后，使用 DAVID 数据库对下游靶基因进行基因本体论（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析，使用 STRING 数据库和 Cytoscape 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和 DEM-核心基因网络。最后，GSE56768 用于验证核心基因的表达。
结果：对 GSE24709，GSE61741 和 GSE31568 三个数据集进行 DEM 分析后共挑选出 9 个（6 个上调和 3 个下调）共同 DEMs。FunRich 软件预测 SP1 可以调控大多数下调的 DEMs，而 YY1 和 E2F1 可以同时调控上调和下调的 DEMs。通过 miRNet 数据库预测了 DEMs 有 1139 个靶基因，其中上调和下调的 DEMs 分别有 596 个和 543 个靶基因。这些靶基因主要富集在 PI3K/Akt，mTOR 和自噬等信号通路。通过 DEM-核心基因网络构建，发现大多数核心基因都可以被 miR-497-5p，miR-130b-5p 和 miR-126-5p 调节。在前 12 个核心基因中，MYC 和 FOXO1 的表达与在 GSE56768 数据集中的表达一致。
结论：在这项研究中，首次在 COPD 血浆中构建了潜在的 miRNA–mRNA 调控网络，这可能为 COPD 的发病机制和治疗提供新的见解。
关键词：微小RNA（miRNA）；慢性阻塞性肺疾病（COPD）；生物信息学分析； miRNA–mRNA 调控网络