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在基因组、转录组和免疫组库水平上对肝细胞癌一线联合免疫治疗的疗效分层

 

Authors Cheng J, Li Y, Wang X, Dong Z, Chen Y, Zhang R, Huang J, Jin X, Yao J, Ge A, Song L , Lu Y, Zeng Z

Received 24 June 2021

Accepted for publication 5 October 2021

Published 27 October 2021 Volume 2021:8 Pages 1281—1295

DOI https://doi.org/10.2147/JHC.S326356

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Editor who approved publication: Dr Mannal M. Hassan

背景: 免疫治疗联合 VEGF 抑制剂已成为晚期或转移性肝细胞癌(HCC)新的一线治疗方法。然而,HCC一线免疫联合治疗的疗效和预后分层的生物标志物尚未明确。
方法: 本研究利用 605-基因 NGS panel 检测了 103 例 HCC 患者治疗前的基因组改变,利用 RNAseq 和 细胞受体(TCR)测序分别获得 18 例一线免疫联合治疗患者的转录组和 TCR 多样性数据。患者接受索拉菲尼/信迪利单抗或伦伐替尼/信迪利单抗联合一线治疗,3-6 个疗程后评估疗效。
结果: TP53TERT 等高频关键驱动基因突变未能对疗效和预后分层。然而,携带 MDM4 扩增变异的患者进展率(PD)明显更高。同样,FGF/3/4/19 扩增变异也可导致高 PD 率。与肝脏代谢和免疫微环境相关的 个基因 DGKITNFSF14CHST4ACTIN1PFKPSLC51BLCK 和 ERN1 的 mRNA 和 lncRNA 水平在 PR/SD 组和 PD 组之间存在显著差异,提示可对疗效进行分层。此外,具有分层作用的基因 CHST4SLC51BERN1 的表达水平与免疫因子 TIGITCD34ICAM1CCL5CXCL9 和 CXCL10 的表达水平之间存在中度相关性,提示这些因子可能在免疫调节中发挥作用。反映 TCR CDR3 多样性的 Shannon-Wiener 指数、Simpson 指数和均一度指数之间存在较强的线性相关性,然而这三个指标在 PR/SD 组与 PD 组间均无显著性差异,说明这些指标对疗效无分层作用。
结论: 我们在一线联合免疫治疗中确定了几个潜在的疗效分层生物标志物。MDM4 能够预测疾病进展,个基因的 mRNA 和 lncRNA 有疗效预测潜力。这些生物标志物的性能还需要进一步的验证。
Keywords: hepatocellular carcinoma, HCC, immunotherapy, mRNA, lncRNA, TCR, sintilimab, sorafenib, Lenvatinib