目的：我们旨在构建竞争性内源性 RNA（ceRNA）网络，并通过生物信息学分析探索克罗恩病（CD）的潜在生物标志物。在 2,4,6-三硝基苯磺酸（TNBS）诱导的实验性结肠炎模型对候选生物标志物进行评估，并在 HCT116 细胞系中对 ceRNA 网络进行验证，从而揭示 CD 的发病机理。
方法：应用 GSE102134 和 GSE67106 数据集，筛选差异表达的基因。应用 WCGNA 确定相关模型构建中 ceRNA 网络。此外，还探索了候选基因与免疫浸润之间的关系。然后，在 TNBS 诱导的实验性结肠炎模型中，通过 qRT-PCR 验证潜在生物标志物的表达。最后，在 HCT116 细胞系中通过 RNA 干扰证实了 ceRNA 网络。
结果：构建了由 4 个 lncRNAs、4 个 miRNAs 和 8 个 mRNAs 组成的 ceRNA 网络，ROC 分析显示 4 个 mRNAs，PTGS2、LPL、STAT1 和 TRIB2 具有较高的诊断准确性（AUC>0.9）。此外，PTGS2 的上调与免疫细胞浸润呈正相关，包括自然杀伤细胞、耗竭 T 细胞、单核细胞、树突状细胞。TNBS 诱导的实验性结肠炎模型的结果验证了 PTGS2 和 mir-429 的表达与之前生物信息学分析的结果一致。此外，所预测的 ceRNA 网络 MIR3142HG/mir-429/PTGS2 通过 RNA 干扰得到验证。敲除 MIR3142HG 会降低 PTGS2 的 mRNA 水平，而抑制 mir-429 会提高 HCT116 细胞系中 PTGS2 的 mRNA 水平。
结论：本研究中对 ceRNA 网络的探索可能有助于了解 CD 的发病机制。构建的 MIR3142HG/mir-429/PTGS2 ceRNA 网络可能在 CD 中起作用，PTGS2 可能是 CD 中潜在的免疫相关生物标志物。
Keywords: Crohn’s disease, ceRNA network, bioinformatics analysis, WCGNA, validation, experimental colitis mice model