简介：食管癌（ESCA）作为一种侵袭性强、预后差的肿瘤，与基因突变的关系尚不清楚。因此，我们试图探讨基因突变在 ESCA 进展中的作用及其与免疫反应、临床治疗和预后的关系。
方法：除了从 2 个公共数据库中获得的常见基因的拷贝数变异（CNV）情况外，还分析了突变与预后/肿瘤突变负荷（TMB）之间的关系。 Kaplan-Meier 生存分析和 Cox 回归分析用于确定 CSMD1 突变状态作为预后的独立预测因子。我们还富集了相关的功能和途径。接下来，分析了 22 个免疫细胞与 CSMD1 突变状态之间的关系。除了高 TMB 组和低 TMB 组免疫检查点抑制剂（ICIs）相关基因表达水平的差异外，以及对还比较了 CSMD1 突变体和野生组之间 ICIs/ m6a/多药耐药相关基因表达水平以及三种化疗药物半数药物抑制浓度的的差异。除了 CSMD1 表达的差异和预后分析外，还进行了这些基因/免疫细胞表达与 CSMD1 表达之间的相关性分析。最后，构建并验证了一个可以高效便捷地预测 ESCA 患者生存概率的列线图。
结果： 我们获得了 17 个频繁突变的基因分布。 CSMD1 的突变和丢失在 ESCA 中很常见。只有 CSMD1 突变可以作为预后不良的独立预测因子。高 TMB 组的患者生存概率较低。野生 CSMD1 可能参与免疫相关通路。在 CSMD1 突变组中发现了更多的辅助 T 细胞和更少的静息状态树突细胞。高 TMB 组的 PD-1 表达更高。野生 CSMD1 组的紫杉醇敏感性和 ABCC1 表达较高。大多数癌症显示出 CSMD1 的差异表达。除 ESCA 的预后外，CSMD1 的表达与免疫细胞含量和 ICIs/m6a/多药耐药相关基因的表达有关。
讨论： CSMD1 突变可作为免疫相关生物标志物来预测紫杉醇的预后和治疗效果。 CSMD1 的突变和缺失可能促进 ESCA 的进展。
关键词：食管癌，CSMD1，TMB，肿瘤浸润免疫细胞，预后