已发表论文

急性胰腺炎和高甘油三酯血症中枢纽基因的鉴定和验证

 

Authors Zhang S , Liang Z, Xiang X, Liu L, Yang H, Tang G

Received 23 November 2021

Accepted for publication 2 February 2022

Published 24 February 2022 Volume 2022:15 Pages 559—577

DOI https://doi.org/10.2147/DMSO.S349528

Checked for plagiarism Yes

Review by Single anonymous peer review

Peer reviewer comments 2

Editor who approved publication: Professor Ming-Hui Zou

背景:急性胰腺炎 (Acute pancreatitisAP) 的发病机制和急性胰腺炎与高甘油三酯血症 (HypertriglyceridemiaHTG) 之间的关系是复杂的,尚未得到完全了解。本研究的目的是确定 AP 和 HTG 之间的核心基因和共同差异表达基因 (Differential Expressed GenesDEGs)
方法:从 GEO (Gene Expression Omnibus) 数据库中下载 AP 的 个基因表达谱和 HTG 的 个基因表达谱,并根据上述 个数据集筛选DEGs。通过基因本体论 (Gene OntologyGO) 术语分析、京都基因与基因组百科全书 (Kyoto Encyclopedia of genes and GenomesKEGG) 通路富集分析和蛋白质-蛋白质互作网络 (Protein-protein InteractionPPI) 构建,确定了核心基因。我们还构建了 miRNA-hub gene 网络,并分别通过高脂饮食和 Caerulein 注射建立了 HTG 和 AP 小鼠模型。最后,通过免疫组化分析验证核心基因在 APHTG 和正常胰腺组织之间的差异表达。
结果:共鉴定出 105 个与 AP 相关的 DEGs 和 149 个与 HTG 相关的 DEGs。此外,我们还鉴定了 AP 的 个核心基因,这些基因都与细胞骨架密切相关,而 AP 和 HTG 之间有 个共同 DEGs。我们还在小鼠模型中验证了它们的表达。最后,我们构建了 miRNA-gene 网络,并鉴定出了调控多个核心基因的 个 miRNAs (hsa-mir-1-3phsa-mir-5195-3phsa-mir-145-5phsa-let-7b-5phsa-mir-10b-5phsa-mir-206 和 hsa-mir-613)
结论:总的来说我们发现 个 AP 相关的核心基因、两个 AP 与 HTG 的共同 DEGs 以及 个可能调控多个核心基因的 个 miRNAs。这项研究可以为进一步阐明高甘油三酯血症性急性胰腺炎的发病机制提供新的思路。
Keywords: acute pancreatitis, biomarkers, hypertriglyceridemia-induced pancreatitis, bioinformatics