目的：脑卒中缺血性损伤后会出现广泛的神经血管炎症，缺血半暗带的基因表达模式发生剧烈变化。然而，参与缺血性卒中急性期炎症反应的关键分子仍不清楚。
方法：从 GEO 数据库中下载两组大鼠缺血性卒中相关的基因表达谱，GSE61616 和 GSE97537，进行基因组富集分析（GSEA）。然后，使用 GEO2R 来筛选差异表达基因（DEGs）。进一步筛选获得 170 个差异表达的交集基因，并对其进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）途径富集分析。通过 DAVID、Metascape、Cytoscape、STRING 和 TargetScan 获得候选靶基因和 miRNAs。最后，构建大鼠大脑中动脉闭塞-再灌注（MCAO/R）模型，并使用 qRT-PCR 来验证预测的潜在 miRNA 分子及其靶基因。
结果：GO 和 KEGG 分析显示，170 个交集基因与炎症细胞的激活和细胞因子的产生高度相关。经过聚类分析，得到七个与中风后神经炎症高度相关的枢纽基因：Cxcl1, Kng1, Il6, AnxA1, TIMP1, SPP1, 和 Ccl6。TargetScan 的结果进一步表明，miR-340-5p 可能同时负向调节 SPP1、AnxA1 和 TIMP1。在 MCAO/R 后 24 小时的大鼠缺血半暗带中，miR-340-5p 的水平与对照组相比明显下降，而 SPP1、AnxA1 和 TIMP1 的浓度上升。时间历程研究表明，SPP1、AnxA1 和 TIMP1 的 mRNA 表达水平在整个脑缺血再灌注（I/R）的急性期波动很大。
结论：我们的研究表明，差异表基因 SPP1、TIMP1 和 ANXA1 可能在脑缺血再灌注损伤急性期的炎症反应中发挥重要作用。这些基因可能受到 miR-340-5p 的负向调节。我们的结果可能为中风后继发性炎症的复杂病理生理机制提供新的见解。
Keywords: SPP1, AnxA1, TIMP1, miR-340-5p, ischemic stroke, acute phase