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微滴数字 PCR 和宏基因组测序在检测 CAR-T 和造血干细胞移植患者 cfDNA 中 HHV-6B 感染的研究比较
Authors Meng J , Ji H, Chen L, Liu A
Received 21 June 2022
Accepted for publication 1 September 2022
Published 9 September 2022 Volume 2022:15 Pages 5353—5364
DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S379439
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Editor who approved publication: Professor Héctor M Mora-Montes
目的:比较 ddPCR 和 mNGS 两种技术检测 HHV-6B 的差异。长期监测 CAR-T 和造血干细胞移植患者的 HHV-6B 的病毒有助于鉴别 ICANS 和 HHV-6B 病毒感染并指导用药治疗。
方法:回顾性分析含有 ddPCR 和 mNGS 两种检测且疑似 HHV-6B 感染的 27 例患者, CAR-T 治疗 19 例,造血干细胞移植 8 例。设计 HHV-6B 探针和引物并评估 ddPCR 性能。采用患者外周血和尿液进行 ddPCR 检测。收集 mNGS 数据和患者临床信息。
结果:ddPCR 检测 HHV-6B 结果和 mNGS 检测 HHV-6B 结果存在较高的相关性(P < 0.001, R2 = 0.672)。27 对时间匹配的样本中,ddPCR 检出 20 例阳性,mNGS 检出 12 例阳性,ddPCR 比 mNGS 多检出 8 例。此外,CAR-T 治疗后患者首次发生 HHV-6B 感染事件的中位时间是 14 天(8-19 天)。ddPCR 长期监测 HHV-6B 可以评估抗病毒疗效。多数患者经过抗病毒治疗后,HHV-6B 病毒拷贝数逐渐降低。
结论:我们结果显示 ddPCR 提高了 HHV-6B 检出率,与 mNGS 形成很好的互补关系。此外,CAR-T 治疗和造血干细胞移植患者长期检测和定量 HHV-6B 病毒载量可以有效指导用药治疗。
关键词:微滴数字 PCR;CAR-T 细胞疗法;造血干细胞移植;HHV-6B 感染;宏基因组测序