已发表论文

基于 RNA 测序技术的人参治疗脓毒症机制研究

 

Authors Wang C , Li S, Shen Y, Li Y, Chen M, Wang Y, Lan Y, Hu Y

Received 12 November 2022

Accepted for publication 16 December 2022

Published 23 December 2022 Volume 2022:15 Pages 7667—7678

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S393654

Checked for plagiarism Yes

Review by Single anonymous peer review

Peer reviewer comments 3

Editor who approved publication: Professor Suresh Antony

目的:利用网络药理学和 RNA 测序技术挖掘人参治疗脓毒症的潜在作用靶点和机制。
方法:依据 Sepsis3.0 标准收集 23 例脓毒症患者和 10 例健康志愿者的外周血样本进行 RNA 测序分析,使用 TCMSP 数据库获取人参的有效成分和作用靶点,对疾病-药物交集基因进行 PPI 分析和 GO 功能富集,并结合 GEO 数据库进行 Meta 分析以筛选核心基因;最后采用单细胞测序对核心基因进行细胞系定位分析。
结果:RNA 测序收集到 4521 个脓毒症相关基因,TCMSP 数据库获得 86 种人参有效成分及其 294 个活性靶点,27 个药物-疾病交集靶点的 PPI 结果显示这些基因紧密相连,GO 分析表明交集基因主要涉及细胞化学应激反应、多细胞有机体过程、药物反应、对细菌来源分子的反应等生物学过程。结合 Meta 分析筛选出 个核心靶点 IL1BALOX5BCL2IL4R,相较于脓毒症死亡组,上述靶点均在脓毒症生存组中高表达;单细胞测序发现 IL1B 主要定位于巨噬细胞系,ALOX5 主要定位于巨噬细胞、细胞系,BCL2 主要定位于自然杀伤细胞、细胞、细胞系;IL4R 广泛分布于免疫细胞。最后,根据 TCMSP 数据库中人参活性成分与靶点的对应关系发现,人参皂苷 rh2 调节 IL1B 的表达,人参皂苷 rf 调节 IL1B 和 IL4R 的表达,山奈酚调节 ALOX5 和 BCL2 的表达,β-谷甾醇调节 BCL2 的表达。
结论:人参的重要活性成分人参皂苷 rh2、人参皂苷 rf、山奈酚、β-谷甾醇可能通过调节靶基因 IL1BALOX5BCL2IL4R 的表达产生抗脓毒症作用,从而提高脓毒症患者生存率。
关键词:人参;脓毒症;RNA 测序;单细胞测序;网络药理学