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宏基因组下一代测序对危重症患者感染的诊断价值及临床应用
Authors He Y, Geng S, Mei Q , Zhang L, Yang T, Zhu C, Fan X, Wang Y, Tong F, Gao Y, Fang X, Bao R, Sheng X, Pan A
Received 7 June 2023
Accepted for publication 14 September 2023
Published 25 September 2023 Volume 2023:16 Pages 6309—6322
DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S424802
Checked for plagiarism Yes
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Peer reviewer comments 3
Editor who approved publication: Prof. Dr. Sandip Patil
目的:评价宏基因组下一代测序(mNGS)对危重患者感染的诊断价值和临床应用。
方法:对 mNGS 和常规微生物方法在 234 例患者的病原体检测中的诊断性能进行比较。还分析了 mNGS 指导的抗感染治疗调整在免疫正常和免疫抑制个体中的差异。
结果:mNGS 对细菌和真菌检测的敏感性和特异性分别为 96.6%(95% 置信区间 [CI],93.5%-99.6%)和 83.1%(95% 置信区间,75.2%-91.1%),以及 85.7%(95% 置信区间,71.9%-99.5%)和 93.2%(95% 置信区间,89.7%-96.7%)。总的来说,mNGS 检测到 152 种病毒,但其中仅 28 种病毒被认为是致病微生物。mNGS 指导的有益抗感染治疗调整在免疫抑制组中的比例大于免疫正常组(48.5% vs. 30.1%;P=0.008)。此外,在血和肺泡灌洗液标本中,mNGS 结果产生临床有益药物调整的比例最高(39.0%;40.0%),但 mNGS 结果对治疗方案无帮助的比例在送检外周血样本的患者中也高达 22.0%。
结论:mNGS 将是一种能为危重感染患者提供精准医疗的有前景的技术。
Keywords: next-generation sequencing, critically ill patients, community-acquired infection, hospital-acquired infection, immunosuppression