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基于 RNA-seq 鉴定恩格列净治疗心肌梗死后心力衰竭的免疫相关关键基因
Authors Zhang P, Wang TY, Luo ZY , Ding JC, Yang Q , Hu PF
Received 3 July 2023
Accepted for publication 10 October 2023
Published 18 October 2023 Volume 2023:16 Pages 4679—4696
DOI https://doi.org/10.2147/JIR.S428747
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Editor who approved publication: Dr Tara Strutt
目的:心力衰竭是急性心肌梗死(AMI)后的严重并发症。研究恩格列净治疗心力衰竭的作用机制至关重要。
方法:用 20 只野生型(WT)雄性 C57BL6/J 小鼠建立心肌梗死后心力衰竭模型,随机分为两组:治疗组和对照组。治疗组接受恩格列净治疗,对照组接受安慰剂治疗。治疗8周后,收集小鼠心脏组织进行二代测序。采用生物信息学方法筛选关键基因。最后,分析了临床数据与基因表达之间的相关性。采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证关键基因的表达。
结果:成功构建了心力衰竭小鼠模型。通过 DEG 分析,治疗组与对照组共有 740 个 DEGs。通过免疫浸润分析,树突状细胞、粒细胞、滤泡B细胞、浆细胞、cDC1、cDC2、pDC 和中性粒细胞是 8 种不同的免疫细胞。通过 WGCNA,选出了与上述不同免疫细胞相关性最高的绿松石模块。通过将 DEGs 与绿松石模块的基因相交,得到了 142 个与免疫相关的 DEGs。通过 PPI 分析和机器学习,最终筛选出 Col17a1 和 Gria4 作为关键的免疫相关基因。在治疗组中,Col17a1 明显上调,而 Gria4 则明显下调。同时,Col17a1 的表达水平与左心室射血分数(LVEF)、左心室缩短分数(LVFS)和左心室收缩期内径(LVIDs)明显相关。
结论:Col17a1 和 Gria4 是恩格列净治疗心肌梗死后心力衰竭的关键免疫相关基因。本研究为阐明恩格列净治疗心肌梗死后心力衰竭的作用机制提供了科学依据。
关键词: 心肌梗死后心力衰竭;恩格列净;免疫;RNA-seq