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基于肝脏非肿瘤组织的肝再生相关基因预测肝细胞癌患者的预后

 

Authors Xu Y, Li Y, Lu Y, Wang W, Lian Z, Wu Z, Li B, Yu D

Received 8 September 2023

Accepted for publication 22 November 2023

Published 7 December 2023 Volume 2023:10 Pages 2197—2209

DOI https://doi.org/10.2147/JHC.S433688

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Editor who approved publication: Dr David Gerber

目的:肝细胞癌(HCC)是一种严重威胁人类生命的恶性肿瘤之一,具有较高的死亡率。早期HCC患者在肝切除后的肝再生能力受到多种因素的影响,包括手术方式和肝脏代谢。本研究旨在基于肝再生相关基因提供一个预后模型,以利用HCC患者的非肿瘤组织预测预后。
方法:本研究共收集了来自三个独立数据库的584个肝细胞癌(HCC)患者的非肿瘤组织样本。采用Kaplan-Meier生存曲线分析,确定了与预后相关的肝再生基因。随后,利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)确定了一个预后指标,称为肝再生分数(LR Score)。独立的队列用于验证LR ScoreHCC患者非肿瘤组织预后之间的关系。此外,通过LASSO Cox回归分析,建立了一个与肝再生相关的模型,以验证鉴定出的关键基因。
结果:本研究构建了一个包含24个与肝再生相关的基因集,并利用LR Score在肝细胞癌患者的非肿瘤组织中预测预后。在HCC患者的非肿瘤组织中,较高的LR Score与更好的预后相关。通过富集分析的结果可发现,非肿瘤组织中较高的LR Score也表明了HCC患者的肝脏代谢较好。随后,本研究通过LASSO Cox回归分析鉴定出两个关键基因,即DHTKD1(脱氢酶E1和转酮醇酮酰基)和PHYH(酸酯酰辅酶A 2-羟化酶)。这两个基因在非肿瘤组织中的表达量越高,HCC患者的预后也越好,并且表达水平也随着肝再生的进展而发生变化。
结论:本研究引入了一个新颖的肝再生相关基因特征,为HCC患者提供了一个从非肿瘤组织估计临床预后的预测模型。LR Score也显示出在预测HCC患者总体生存方面是一个可靠的指标。
关键词:肝细胞癌,非肿瘤组织,肝再生,预后。