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麻风后遗症患者下肢溃疡的代谢组学和16SrDNA 测序分析

 

Authors Wang J, Wang B, Liang C, Jin C, Shen H 

Received 19 September 2023

Accepted for publication 28 November 2023

Published 5 December 2023 Volume 2023:16 Pages 3465—3480

DOI https://doi.org/10.2147/CCID.S441000

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Editor who approved publication: Dr Jeffrey Weinberg

目的: 本研究调查了麻风病后遗症患者下肢溃疡组织和周边正常皮肤之间的微生物组和代谢组差异。

方法:选取28例麻风治愈患者下肢溃疡组织及周围正常皮肤,采用Illumina NovaSeq平台对样品进行16SrDNA测序分析,分析皮肤表面微生物群落结构和多样性,然后采用LC-MS技术进行非靶向代谢组学分析,统计筛选差异代谢物,进行代谢途径分析。采用Spearman方法分析差异微生物群与差异代谢物之间的相关性。

结果:与正常皮肤相比,溃疡组织的微生物α多样性下降,但差异不显著(observed species, Chao1, Shannon, Simpson, and Pielou’s evenness index; P > 0.05)。相反,Jaccard distance表明,样品β-多样性呈现一定程度的聚类(P < 0.05),两组间差异显著。LEfSe分析结果显示,与正常皮肤相比,溃疡组织中Flavobacteriaceae, Flavobacteriales, Lachnospiraceae, Lachnospirales, Enterobacterales, Acinetobacter, and Moraxellacea的微生物丰度显著降低,可能与溃疡状态有关。Spearman相关分析表明,皮肤代谢组和皮肤微生物组之间存在很强的相关性。

结论:麻风后遗症患者下肢溃疡皮肤微生态和代谢物受到干扰,物种多样性降低,皮肤代谢物类型依赖于微生物群。