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PVALB是与免疫密切相关的HCC独立预后因子,降低PVALB表达可以调节NK细胞浸润从而影响肿瘤进展
Authors Gong Y, Zhou M, Zhu Y, Pan J, Zhou X, Jiang Y, Zeng H, Zheng H, Geng X, Huang D
Received 30 November 2023
Accepted for publication 23 April 2024
Published 8 May 2024 Volume 2024:11 Pages 813—838
DOI https://doi.org/10.2147/JHC.S450479
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Editor who approved publication: Dr David Gerber
目的:肝细胞癌是最常见的原发性肝癌,预后较差。肝脏复杂的免疫微环境与HCC的发生发展相关。PVALB是一种钙结合蛋白,在甲状腺癌和神经胶质瘤中被报道为抑癌基因。然而,PVALB在HCC中的作用尚不清楚。
材料和方法:我们从TCGA和GSE54236数据集获得数据。通过MCP-counter、WGCNA和LASSO模型来筛选确定PVALB。利用UALCAN、MethSurv等网站检测PVALB的表达、甲基化和生存情况。利用LinkedOmics和GSEA进行功能分析,利用TIMER、TISIDB、Kaplan-Meier plotter、TIDE数据库评估PVALB与肿瘤免疫微环境的相关性并预测免疫治疗疗效。利用TargetScan、DIANA、LncRNASNP2数据库及相关实验构建ceRNA网络。最后利用GeneMANIA、CTD等对PVALB进行分子对接和药物敏感性分析。
结果:PVALB被认为是与HCC和NK细胞相关的基因。其在肝癌组织中表达下调,导致不良预后。此外,PVALB的低甲基化与其表达减少有关。值得注意的是,PVALB与免疫密切相关,其表达降低通过Fas/FasL途径减弱了NK细胞的抗癌作用,导致不良结局。lnc-YY1AP1-3/hsa-miR-6735-5p/PVALB轴可能调控PVALB的表达。最后,我们发现免疫治疗可能是一种可行的治疗选择。
结论:总之,PVALB是一个独立预后因子, 降低PVALB表达 通过影响NK细胞浸润促进HCC进展。