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基于铁死亡状态鉴定低级别胶质瘤抗原用于mRNA疫苗开发

 

Authors Zhao Z , Xing N , Guo H , Li J , Sun G 

Received 10 November 2023

Accepted for publication 16 March 2024

Published 11 April 2024 Volume 2024:17 Pages 105—123

DOI https://doi.org/10.2147/PGPM.S449230

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Editor who approved publication: Dr Martin H Bluth

目的:mRNA疫苗是癌症免疫治疗领域的创新性策略,其在治疗低级别胶质瘤(LGG)的有效性尚需评估。铁死亡与癌症的发生、发展密切相关。在本研究中,我们探索了与铁死亡相关的肿瘤微环境,以促进针对LGG患者的mRNA疫苗的开发。

方法: 从癌症基因组图谱(TCGA)和中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库中提取了LGG患者的基因组和临床数据。通过差异表达、突变状态、与抗原提呈细胞的相关性以及与免疫原性细胞死亡(ICD)的预后相关性,我们鉴定了与铁死亡相关的肿瘤抗原。使用实时聚合酶链反应(RT-PCR)验证了LGG组织样本和细胞系中的抗原表达水平。最后,采用共识聚类方法对患者进行分类,进一步表征铁死亡亚型的免疫景观,包括免疫反应、预后评估能力、肿瘤微环境特征等。

结果: 共鉴定出五个肿瘤抗原,分别是HOTAIRIDO1KIF20ANR5A2RRM2RT-PCR显示这些基因在LGG中的表达水平高于对照组。定义了LGG12个基因模块和4种铁死亡亚型(FS1-FS4)。其中,FS2FS4亚型的肿瘤突变负荷(TMB)和免疫检查点蛋白(ICPs)较低,具备“冷”表型的特征,更适合接种mRNA疫苗。

结论: HOTAIRIDO1KIF20ANR5A2RRM2可作为开发LGG mRNA疫苗的肿瘤抗原,尤其适合FS2FS4亚型患者。

关键词:铁死亡、低级别胶质瘤、mRNA疫苗、免疫治疗