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基于Anoikis resistance的COPD诊断和预测模型的建立

 

Authors Hu W, Sun J , Wang M, Wang Y , Mu C, Yu X , Yuan P, Han W, Li Y, Li Q 

Received 15 April 2025

Accepted for publication 31 August 2025

Published 6 September 2025 Volume 2025:18 Pages 12263—12278

DOI https://doi.org/10.2147/JIR.S534626

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Editor who approved publication: Prof. Dr. Yuhan Xing

摘要

背景

慢性阻塞性肺病(COPD)是以气道炎症和重构为特征,慢性支气管炎和肺气肿为病理改变的慢性呼吸系统疾病,Anoikis resistance (AR)在多种疾病中参与慢性炎症和凋亡等病理过程,然而其在 COPD发病机制中的作用尚不清楚。本研究旨在鉴定AR相关枢纽基因表达,并评估其在COPD表型和预后中的临床意义。

方法

通过对GSE11906数据集的综合生物信息学分析,获得与AR相关的差异表达基因(DEGs)。采用Least Absolute Shrinkage and Selection Operator(LASSO)回归分析和多种机器学习算法(SVM, RF,XGB和GLM)鉴定核心枢纽基因。对核心枢纽基因的多层次验证包括外部数据集(GSE19407)、临床样本(PBMCs)、体内(香烟烟雾暴露小鼠)和体外(CSE刺激的16HBE细胞)等试验,并使用逻辑回归的方法建立诊断和预后模型。

结果

我们鉴定出5个核心枢纽基因(UCHL1、ME1、SLC2A1、BMP4、CRABP2),其中ME1、SLC2A1和BMP4在COPD中上调,且与肺气肿指数(负相关,R = -0.41 ~ -0.45)和气道壁厚(正相关,R = 0.40 ~ 0.45)密切相关。此外,这些核心枢纽基因与气道周围免疫细胞浸润有显著相关性。基于AR核心基因的“肺气肿型”COPD诊断模型(AUC = 0.860)、疾病分期(AUC = 0.882)及住院时间预后模型(AUC = 0.867)均显示出良好的临床效用。

结论

ME1、SLC2A1 和 BMP4 等 AR相关基因可驱动COPD免疫失调和气道重塑,由其构建的诊断和预后模型能够实现COPD精准的表型分析、严重程度分层和个性化预后预测,推进慢性阻塞性肺病管理的精准化和个性化。

关键词:Anoikis resistance;  COPD;  肺气肿 ;  慢性支气管炎